Ympäristöministeriön käynnistämä Helmi-elinympäristöohjelma vahvistaa Suomen luonnon monimuotoisuutta ja turvaa luonnon tarjoamia elintärkeitä ekosysteemipalveluja. Samalla hillitään ilmastonmuutosta ja edistetään siihen sopeutumista. Kortejärvi kuuluu lintuvesiosioon, missä kunnostetaan lintuvesiä ja kosteikoita ranta-alueineen.
Hanketta koordinoinaan Varsinais-Suomen ELY-keskuksesta. Kortejärvi on matala umpeenkasvusta kärsivä Natura-alue. Umpeenkasvu haittaa jo lintujen pesintää ja saalistusta. Toimenpiteet ovat vielä suunnitteluasteella. Toiminta tulee tapahtumaan yhteistyössä paikallisten toimijoiden kuten suojeluyhdistyksen, osakaskuntien ja riistayhdistysten kanssa.
Mahdolliset toimenpiteet voivat olla esimerkiksi pienpetojen hävittämistä, pesintäsaarien rakentamista, koekalastusta ja kasvillisuuden niittoa tai ruoppausta. Pesimääsaarekkeilla houkutellaan lokkeja pesimään järvellä. Lokkien pesintä voi turvata muiden lintulajien pesintää.